Rise of the Apes er en oprindelseshistorie i den sande form. Filmen foregår i nutidens San Francisco og er en virkeligheds-baseret advarselsfortælling – en blanding mellem science fiction og science fact – hvor en mand eksperimenterer med genetisk ingeniørarbejde. Det fører til udviklingen af intelligens hos aber og begyndelsen på en krig om overherredømme.